遺伝子同定

Test Method

検査方法

真菌培養で分離された真菌について、遺伝子配列を解析してより詳細で精度の高い同定を行います。

純培養した真菌コロニーからDNAを抽出し、真菌全般を幅広く検出できる「ユニバーサルプライマー」を用いてPCRを行います。一般的な「○○病のPCR検査」のように、特定の病原体のみを検出するPCRではないため、菌種の予測がつかない場合でも検査を行うことができます。

ユニバーサルプライマーによるPCRでは、「真菌であること」はわかりますが、菌種まで特定することはできません。このため、PCRで増幅した塩基配列をさらに解析（シーケンス）し、その配列をデータベースと照合して同定します。このようにPCRとシーケンスを組み合わせて、正確な種レベルでの同定を行います。

ユニバーサルプライマーにはいくつか種類があり、培養された真菌のコロニー性状や鏡検所見から菌種を予想し、より適したプライマーを選んでいます。使用する遺伝子領域には、リボソームRNA遺伝子のITS領域やD1/D2領域、さらにβチューブリン遺伝子、カルモジュリン遺伝子などがあり、これを適切に選択することで同定の精度を高めています。

※培養をせず検体から直接遺伝子同定を希望される場合は、Direct-Fungiをご利用ください。

【検査の流れ】