検査案内
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検査の詳細をみる培養された真菌の遺伝子解析による正確な同定検査。
遺伝子解析による正確な同定。
検体を培養し、DNA抽出、PCR、シーケンスを行いDNA塩基配列から同定します。
真菌培養で分離された真菌について、遺伝子配列を解析してより詳細で精度の高い同定を行います。
純培養した真菌コロニーからDNAを抽出し、真菌全般を幅広く検出できる「ユニバーサルプライマー」を用いてPCRを行います。一般的な「○○病のPCR検査」のように、特定の病原体のみを検出するPCRではないため、菌種の予測がつかない場合でも検査を行うことができます。
しかしユニバーサルプライマーによるPCRでは、「真菌であること」はわかりますが、菌種まで特定することはできません。菌種を同定するには、PCRで増幅した塩基配列をさらに解析(シーケンス)し、その配列情報をデータベースと照合する必要があります。こうしたPCRとシーケンスを組み合わせた解析によって、正確な種レベルでの同定を行います。
さらに、真菌コロニーの形態もあわせて観察し、そこから予測される真菌群に応じて使用するユニバーサルプライマーを選定しています。使用する標的領域には、リボソームRNA遺伝子のITS領域やD1/D2領域、βチューブリン遺伝子、カルモジュリン遺伝子などがあり、これを適切に選択することで同定の精度を高めています。
※培養をせず検体から直接遺伝子同定を希望される場合は、Direct-Fungiをご利用ください。
【検査の流れ】