遺伝子同定

Test Method

検査方法

真菌培養で分離された真菌について、遺伝子配列を解析してより詳細で精度の高い同定を行います。

純培養した真菌コロニーからDNAを抽出し、真菌全般を幅広く検出できる「ユニバーサルプライマー」を用いてPCRを行います。一般的な「○○病のPCR検査」のように、特定の病原体のみを検出するPCRではないため、菌種の予測がつかない場合でも検査を行うことができます。

しかしユニバーサルプライマーによるPCRでは、「真菌であること」はわかりますが、菌種まで特定することはできません。菌種を同定するには、PCRで増幅した塩基配列をさらに解析（シーケンス）し、その配列情報をデータベースと照合する必要があります。こうしたPCRとシーケンスを組み合わせた解析によって、正確な種レベルでの同定を行います。

さらに、真菌コロニーの形態もあわせて観察し、そこから予測される真菌群に応じて使用するユニバーサルプライマーを選定しています。使用する標的領域には、リボソームRNA遺伝子のITS領域やD1/D2領域、βチューブリン遺伝子、カルモジュリン遺伝子などがあり、これを適切に選択することで同定の精度を高めています。

※培養をせず検体から直接遺伝子同定を希望される場合は、Direct-Fungiをご利用ください。

【検査の流れ】